Hvis fettalkoholer som inneholder 16 eller flere karbonatomer per molekyl brukes i syntesen av alkylpolyglykosider, er det resulterende produktet løselig i vann bare ved svært lave konsentrasjoner, vanligvis en DP på 1,2 til 2. De omtales heretter som vannuløselige alkylpolyglykosider. Blant disse alkylpolyglykosidene er de ikke-polare egenskapene dominerende på grunn av den lange alkylkjeden. Disse brukes ikke som overflateaktive stoffer, men brukes primært som emulgatorer i kosmetiske formuleringer.
Den observerte reaksjonen av glukose med dodekanoler/tetradekanoler er i stor grad anvendelig for syntesen av vannuløselige alkylpolyglykosider, slik som cetyl/oktadecylpolyglykosider. Syrekatalyserte reaksjoner finner sted ved lignende temperaturer, trykk og molforhold mellom råstoffene. På grunn av deres lave løselighet er disse produktene imidlertid vanskeligere å raffinere og bleke som vannbaserte pastaer. Det er viktig å produsere produktene med lavt innhold og lys farge direkte etter reaksjonstrinnet, og dermed unngå ytterligere behandling.
Det viktigste uønskede biproduktet er polyglukose. Den er gulbrun og forringer dermed fargen betydelig. I tillegg gjør tilstedeværelsen av høye konsentrasjoner av polyglukose det vanskelig å konsentrere reaksjonsblandingen ved destillasjon, fordi polyglukose har en tendens til å dekomponere veldig raskt når temperaturen stiger. Dette forringer også ytelsesegenskapene.
Siden dannelseshastigheten for polydekstrose øker betydelig mot slutten av reaksjonen, avsluttes reaksjonen for tidlig ved omtrent 80 % glukoseomdanning ved å senke temperaturen og nøytralisere katalysatoren. For å sikre jevn og reproduserbar produktkvalitet brukes online-analyse for å spore transformasjonen nøyaktig. Ved avslutning er den ureagerte glukosen tilstede som et suspendert fast stoff og kan enkelt fjernes ved påfølgende filtrering. Etter fjerning av glukose inneholder produktet omtrent 1–2 q polydekstrose, som emulgeres i svært fine dråper. Ved å velge riktig filterhjelpemiddel kan polydekstrose fjernes fullstendig i det andre filtreringstrinnet.
Ved denne prosessen oppnås et vesentlig glykose- og polydekstrosefritt produkt som inneholder 15 til 30 % langkjedede (C16/18) alkylpolyglykosider og 85 til 70 % fettalkohol (C16/18-OH). Siden produktet har et forhøyet smeltepunkt, markedsføres det vanligvis som et fast stoff i form av flak eller pellets.
Høye nivåer av langkjedede alkoholer er akseptable fordi mange kosmetiske kremer inneholder store mengder av den samme alkoholen. Derfor kan alkylpolyglykosider brukes direkte som alkylpolyglykosider/fettalkoholer.
De relativt nyere typene vannløselige alkylpolyglykosider inneholder omtrent 500 % alkylpolyglykosider og 500 % fettalkoholer. I dette tilfellet fjernes en del av fettalkoholen ved vakuumdestillasjon, og den termiske nedbrytningen undertrykkes ved å holde temperaturen og oppholdstiden så lav som mulig. (Figur 7) Denne konsentrerte produkttypen utvider bruksområdet for vannløselige alkylpolyglykosider betraktelig.